Las funciones que realiza este departamento, le permite a la FEPCMAC atender servicios relacionados al Gobierno Corporativo y al Sistema de Control Interno a las Cajas Municipales de Ahorro y Crédito (CMAC), tales como: seleccionar a la asociación MYPE más representativa para que designe a un miembro en el directorio de las CMAC, gestionar para el pronunciamiento sobre el nombramiento de gerentes de las CMAC,  realizar compras corporativas de servicios y/o consultorías a cargo de empresas especializadas y proveer servicios a las CMAC de acuerdo con la normatividad vigente, así como proponer normas relacionadas al sistema de control interno.

A nivel interno, participa en la implementación de las prácticas de gobierno corporativo, del sistema de control interno y acuerdos de los órganos de dirección de la FEPCMAC, y es responsable de la función de cumplimiento normativo. Asimismo, apoya a la gerencia en la implementación de las recomendaciones de los órganos de supervisión y control de la FEPCMAC.